El 12 de Octubre de 1912, la M. Francisca deja de ser superiora y se le confía el cargo de Maestra de novicias, ella mas que nadie formaría a las futuras religiosas de su instituto, durante 9 años paso modelando el espíritu de sus religiosas, hasta que en 1921 es nombrada superiora de la Congregación. En el año 1923, un 24 de septiembre marcara un hito en la historia de la Congregación con la fundación de la Primera escuela rural, en la Esperanza, fue el inicio de otras fundaciones se que habrían de suceder. En 1.926 se abre otra escuela en Sangolquí y en 1.931 en el Quinche, Provincia de Pichincha. En 1.933 en Milagro, Provincia del Guayas. Cotacachi en 1.935, Provincia del Imbabura.

En 1.936 en Salcedo, Provincia de el Cotopaxi. En este mismo año se inician obras misionales en Zamora. Siguen las fundaciones en Guayaquil y Pomasqui, 1.941. Loja en 1.942. Riobamba, 1.944. Libertad en 1.948. Yacuambi 1.949, Provincia de Zamora Chinchipe. Tabacundo y Cotocollao en 1.951.Pensionado Santa Rosa de Viterbo en Quito. Escuela misional en Cumbaratza 1.959. Temuco, Chile 1.960. El Colegio Alvernia, 1.962 y finalmente Valparaíso Chile, en 1964.     

El grano de mostaza, sembrado en el campo ha crecido a los ojos de la fundadora hasta hacerse un árbol y ha echado ramas tan grandes que las aves del cielo  pueden habitar bajo sus sombras. Más de 12.000 niñas y jóvenes, hijas de un pueblo que forcejea por desarrollarse y promoverse se acogen al abrigo de la congregación de Franciscanas Misioneras de la Inmaculada, para recibir educación y los beneficios de su espíritu de servicio y caridad.